Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BROXQ5VW32 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms