Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms