Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms