Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD9Q5K651 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD9Q5K651 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms