Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms