Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGD3Q5JSP0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGD3Q5JSP0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGD3Q5JSP0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms