Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms