Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms