Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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