Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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