Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms