Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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