Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPEGQ15772 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPEGQ15772 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms