Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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