Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms