Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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