Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAPQ14761 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms