Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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COL9A2Q14055 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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COL9A2Q14055 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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