Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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COL9A3Q14050 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A3Q14050 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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