Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms