Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms