Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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