Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.42e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.381e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.373e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.374e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.366e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.15■■□□□ 1.33e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-211ENST00000433619 706 ntTSL 523.01■■□□□ 1.273e-6■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.213e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-214ENST00000442929 500 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.173e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.167e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.137e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.137e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 OXLD1-205ENST00000573786 678 ntTSL 221.51■■□□□ 1.033e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AARSD1-218ENST00000592136 457 ntTSL 221.08■□□□□ 0.977e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-213ENST00000542347 988 ntTSL 220.87■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.933e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.933e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-211ENST00000474328 606 ntTSL 520.8■□□□□ 0.923e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.873e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.863e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.857e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SGF29-205ENST00000567447 726 ntTSL 220.31■□□□□ 0.843e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.764e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.756e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.733e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.723e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.723e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.713e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.712e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.693e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZDHHC12-205ENST00000467312 2536 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AARSD1-207ENST00000474578 625 ntTSL 519.3■□□□□ 0.687e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.687e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-220ENST00000497506 568 ntTSL 319.13■□□□□ 0.653e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.647e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.627e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AARSD1-216ENST00000591096 562 ntTSL 218.86■□□□□ 0.617e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.616e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.617e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GPR137-207ENST00000536282 362 ntTSL 518.72■□□□□ 0.597e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-206ENST00000412894 832 ntTSL 518.67■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.563e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ICAM3-207ENST00000589900 2057 ntTSL 218.34■□□□□ 0.537e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.522e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HIRIP3-202ENST00000563053 1686 ntTSL 218.29■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 UBE2F-219ENST00000455999 760 ntTSL 518.29■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SUGP1-210ENST00000589144 2066 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.53e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AARSD1-215ENST00000587023 539 ntTSL 218.18■□□□□ 0.57e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ICAM3-209ENST00000592439 905 ntTSL 518.04■□□□□ 0.487e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.467e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ICAM3-210ENST00000592945 658 ntTSL 217.8■□□□□ 0.447e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-209ENST00000421517 853 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-219ENST00000492763 587 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)17.78■□□□□ 0.443e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TBC1D17-207ENST00000599049 1742 ntTSL 517.67■□□□□ 0.423e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.417e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.47e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MAF1-203ENST00000527572 737 ntTSL 317.45■□□□□ 0.386e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.383e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 217.22■□□□□ 0.353e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ICAM3-203ENST00000587992 2491 ntTSL 217.14■□□□□ 0.347e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.337e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.323e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TSPAN31-209ENST00000549052 1100 ntTSL 316.98■□□□□ 0.313e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ATP6V1H-218ENST00000524164 1734 ntTSL 516.85■□□□□ 0.292e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.287e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-215ENST00000544831 814 ntTSL 216.73■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■□□ 15.2
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