Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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