Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MRPL28Q13084 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MRPL28Q13084 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MRPL28Q13084 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MRPL28Q13084 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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MRPL28Q13084 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms