Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNDQ07001 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms