Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms