Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms