Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms