Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms