Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFDNP55196 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFDNP55196 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms