Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPAP53621 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPAP53621 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPAP53621 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms