Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms