Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms