Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms