Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5F1P24539 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms