Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms