Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSHP23434 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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GCSHP23434 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSHP23434 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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