Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms