Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VCLP18206 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VCLP18206 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VCLP18206 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VCLP18206 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms