Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms