Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BMP3P12645 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BMP3P12645 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BMP3P12645 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms