Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRP12270 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRP12270 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPRP12270 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPRP12270 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms