Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PYGBP11216 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PYGBP11216 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms