Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGAP10645 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHGAP10645 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGAP10645 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms