Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms