Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRAP08240 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms