Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TK1P04183 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TK1P04183 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TK1P04183 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms