Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA0556O60303 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms