Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNMO15061 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNMO15061 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms